Projektantrag FIAE , ist alles okay ???

[muT-ant-]

hi @ all

hab meinen projektantrag soweit fertig und hätte gerne resonanzen von euch (bevor ich ihn losschicke), also bitte schreib was :

1. Projektbezeichnung

Modulare Implementierung eines Programms zur linearen Registrierung in das AMIRA Visualisierungs-System

2. Projektbeschreibung (Kurzform)

Auftraggeber ist das XXX für neurologische Forschung , in XY , welches sich mit der Entwicklung und Anwendung von funktionellen NMR-Methoden (Perfusions- und Diffusionsbildgebung, BOLD-Bildgebung) in der experimentellen Tumor- und Ischämieforschung und der Beschreibung von biophysikalischen Prädiktoren der Erholungsfähigkeit des Hirngewebes beschäftigt.

Gewünscht wird von Seiten des XXX die Erweiterung der 3D Visualisierungssoftware AMIRA, um ein neues Modul. Dies ist ein Universalwerkzeug zur Darstellung und Verarbeitung von zwei- und dreidimensionalen Bildern und dient der linearen Registrierung. Als Registrierung wird der Vorgang bezeichnet bei dem zwei Bilddatensätze angepasst werden, so dass Hirnstrukturen von einzelnen Aufnahmen nahezu positionsgenau überlagert werden können. Ziel der Überlagerung ist die Darstellung der Veränderung im Gehirn nach einer bestimmten Zeit, um insbesondere Positionen von vorher implantierten Stammzellen im Hirngewebe zu analysieren.

- Derzeitiger Zustand

Die Schichtaufnahmen verschiedener Messzeitpunkte müssen im AMIRA Programm von Hand unter zu Hilfenahme von sogenannten Landmarken aufeinander abgestimmt werden, diese Landmarken sind allerdings nur bedingt geeignet da übereinstimmende Positionen schwer zu finden sind Rauschen, Artefakte und unterschiedliche Positionen der Schichten verhindern dies. Zur Zeit werden zur Verarbeitung der Bilddaten die Software Bibliotheken FSL (FMRIB Software Libary), FLIRT (FSL Linear Registration Tool) verwendet. Diese Programme enthalten mehrere Deformationsmodelle, Optimierungs- und Interpolationsfunktionen und müssen außerhalb des AMIRA Visualisierungs-Systems gestartet werden.

- Zielsetzung

Entwicklung eines Moduls das automatisch Abweichungen und Veränderun-gen verschiedener Bildserien und Volumina berechnet und miteinander vergleicht und dabei lineare Registrierung benutzt.

Verbesserung der Wirtschaftlichkeit, da das umständliche Erzeugen von „Headerdateien“ für die Verarbeitungsparameter, die die FSL/FLIRT Programme benötigen, entfallen und ein zeitsparendes Vorgehen innerhalb der AMIRA Software möglich ist.

- Notwendige Programmteile

Der vorhandene Algorithmus der XXX soll in das AMIRA Programm eingebettet werden. Dazu ist der Entwurf einer Schnittstelle, einer Ein- und Ausgabefunktion und einer Benutzeroberfläche notwendig (basierend auf C++).

3. Projektumfeld

Das XXX für besitzt ein NMR (Nuklear Magnetic Resonace / Kernresonanz) Labor mit 2 hochauflösenden Tomographen (4,7 und 7 Tesla) für tierexperimentelle Studien zur Therapie des experimentellen Hirninfarktes. Zur Bildbearbeitung sind zwei Silicon Graphics Workstation O2, mit einem IRIX 6.5 Betriebssystem vorhanden, wobei auf einem das AMIRA Visualisierungssystem 2.3 installiert ist mit dem das neue Modul zum Einsatz kommen soll.

Durchführungszeitraum (geplant):

- Vom 15. September 2003

- Bis 30. September 2003

Projektverantwortlicher im Ausbildungsbetrieb:

- MR. X

4. Projektinhalte

- Verständnis der Struktur des einzubringenden Algorithmus

-Zusammenstellung des Pflichtenhefts ca. 8 Std.

- Entwurf und Umsetzung der Benutzeroberfläche ca. 10 Std.

(basierend auf Amira Developer Version 2.3)

- Entwicklung eines Interface zum Datenaustausch zwischen

der AMIRA Applikation und dem in der Programmiersprache C

verfassten Algorithmus (basierend auf C++) ca. 8 Std.

- Entwicklung eine Ein- und Ausgabefunktion zum externen

speichern der Bearbeitungsparameter ca. 14 Std.

- Modulare Einbettung der Applikation in das Visualisierungssystem

(basierend auf Amira Developer Version 2.3) ca. 12 Std.

- Testen der Funktionalität und Anwendung des Moduls ca. 4 Std.

- Anfertigung der Dokumentation, Benutzerhandbuch ca. 14 Std.

5. Projektdokumentation

- Projektbericht (u.a. Erläuterung der Spezifischen Details zum allgemein Verständnis der NMR und der linearen Registrierung)

- Ausdruck des kommentierten Quellcodes des entwickelten Moduls

- Diagramm zur Veranschaulichung der Funktionsweise des implementierten Moduls

- Grafische Darstellung (Screenshots) der Funktion

- Ergebnisse des Tests