Hallo,
Du kannst dich schon auf deinem FTP-Server einloggen??
Wenn ja--> wirst du beim Login in das homeverzeichnis der jeweiligen Users weiter geleitet um dies zu ändern mußt du mittels
usermod -d /ordner user dem user das "neue" Verzeichnis zuweisen.
Anschließend mußt du die Berechtigungen+Eigentumsrechte ändern.
PS:Um die Speicherung auf einer Eigenen Partion zu bewerkstelligen müßte man sich schon bei der Installation Gedanken über die Größe der Partition machen und sie dementsprechend partitionieren.