dafür gibt es ein geiles Tool von IDM. Es nennt sich UltraCompare und kann Dateien Vergleichen und Zusammenfügen. Es bietet eine Fülle von Funktionen, die das Aufspüren von Unterschieden zwischen Dateien, Verzeichnissen, Word-Dokumenten und .ZIP-Archiven ermöglichen, z.B. Text- oder Binärvergleiche, zwei- oder dreifach Dateienvergleich, Unterschiede zusammenführen, Inline-Bearbeitung,
Das Schwestertool ist gerade in der c't 23/09 gehyped worden.
Gibts hier: IDM Deutschland, living-C - UltraEdit, UEStudio, UltraCompare und UltraSentry