Ich würde die Mail auch kurz halten. Sehr geehrte(r) Frau/Herr X,
im Anhang befindet dich meine Bewerbung für die Stelle des..... (Hier steht manchmal auch ein Code, diesen kannst du mit angeben, ist aber kein muss)
Die Dateien würde ich nicht als eine PDF verschicken:
PDF für Anschreiben und Lebenslauf. (Wird manchmal auch getrennt gefordert also Anschreiben.pdf, Lebenslauf.pdf)
PDF für Zeugnisse (Noten) und Zertifikate und
PDF für Arbeitszeugnisse.
So wird es meistens gefordert. Du kannst natürlich auf der Internetseite schauen und gucken, ob diesbezüglich Angaben gemacht wurden.