Das Arbeiten als root unter X ist von vornherein eigentlich überfüssig!
Alle administrativen Tätigkeiten können auch bequem aus aus einem XTerm erledigt bzw. gestartet werden. Dass soll heißen, es reicht aus eine XTerm aufzumachen, sich mit 'su' root-Privilegien ergattern. Daraufhin läuft jedes aus dieser Konsole gestartete Programm unter der UID=0, also root.
Der Kernpunkt an der ganzen Sache ist, loggt man sich als root unter X ein, somit laufen alle Programme danach unter der UID=0, da sie ja die ID vom Vaterprozess erben.
Spind man den Faden weiter, so kann es bei einem Programmabsturz zu irreversiblen Schäden kommen, da man ja als root Schreiberechte auf alle Systemdaten hat.
Also man arbeitet am besten nie unter X als root, also in deinem Fall bestimmt KDE.
MfG