Golebin

Vollkommen richtig.
Ansonsten: Der Drops ist gelutscht. 
Sich nett und höflich bedanken und sagen, dass ein Wechsel unter ökonomischer Sicht nicht sinnvoll ist. Wenn sie dann plötzlich wieder erhöhen sollten, würde ich dennoch absagen. Einmal bis an sein persönliches Limit gehen ist gut, aber dann nochmal? Wir sind doch nicht auf dem türkischen Basar. Ist schlechter Stil. Und wenn das schon im VG raus scheint, wie ist erst dann im Alltagsbetrieb?
Mal abgesehen davon: 40/42.5k sind 100 EUR netto mehr im Monat. Nach 12 Monaten hast Du also einen "Mehr" von 600 EUR an Gehalt, fährst in den ersten dafür Verluste ein. Am Ende stehen knapp 700 EUR an reinen Benzinkosten. Und da ist das notwendige Auto noch nicht einmal eingerechnet. 
Unter dem Strich schon rein finanziell ein riesen Verlust vom ersten Tag an. Und wenn Du auch noch den Verlust von Lebensqualität und den Zeitverlust durch min. 40 Min längeren Arbeitsweg pro Tag mit einrechnest sollte die Entscheidung mehr als klar sein.
 

Ich wage zu behaupten, in Süddeutschland wärst du schon untergekommen und das bei min 3000 brutto.
Berlin iszt einfach ne doofe Stadt, wo man auch oft viel Glück haben muss. Wenig wirkliche Industrie, viele Start-ups, viele Menschen die "irgendwas mit Medien, IT, Programmieren usw" machen wollen. Haufen Unis und Hochschulen die Informatiker aller Form auf den Markt werfen. Drum herum auch viele Städte mit Unis/FHs, aber auch wenig Arbeit.

Berlin ist "Hipster-Hochburg" also Leute die Hauptsache was cooles machen wollen, Geld ist nicht so wichtig. Programmieren ist cool, mit 35 in der WG wohnen auch, also arbeite ich mit Bachelor Medieninformatik für 2400 brutto nach 5 Jahren.
Wenn du nicht gebürtig da her bist und kranke Eltern hast würde ich auch weiter weg suchen.
1h um Berlin gibt es doch eh nix außer noch höhere Arbeitslosenquote.