IMHO arbeitet eine Suchmaschine vor allem über Links. Das heißt, der Roboter der Suchmaschine geht dann auf die einzelnen Links ein und indiziert die Ziele und geht rekursiv weiter. Ein wenig steuern kannst du mit einer robots.txt. Was die MySQL-Daten angeht:
Sobald der Spider (Roboter) auf einen Link trifft und diesen von deinem Server anfordert, dann generiert der Server ja wie gewohnt die Datei mit u.U. DB-Inhalten. Dieser ermittelte Inhalt wird dann indiziert. Aber ich glaube nicht, daß du den Roboter anweisen kannst, den Inhalt der MySQL-Datenbank zu indizieren. Würde sowieso nicht viel bringen, da der User nicht weiß, wie er jetzt an diese Daten drankäme.